Согласно постановлению контрольное управление Новосибирской области наделяется дополнительными полномочиями по проведению проверок своевременности и качества исполнения контрольных заданий, организации данной работы в структурных подразделениях администрации Губернатора Новосибирской области и Правительства Новосибирской области, исполнительных органах государственной власти Новосибирской области  с последующим докладом Губернатору Новосибирской области об итогах проведенных проверок.  

       Кроме того, контрольному управлению Новосибирской области поручается работа по совершенствованию координации, аналитической и методической деятельности в сфере контроля.